水晶底拖鞋39码的起针数，实际上可能会因编织者的手法和所用线材的粗细而有所差异。但一般来说，39码的拖鞋起针数会有一个相对固定的范围。

在手工编织中，起针数的确定通常需要考虑到拖鞋的大小、形状以及编织的紧密度。对于39码的拖鞋，起针数可能会比38码稍多一些，但具体多多少针则没有固定的标准。一些编织教程可能会给出大致的起针数范围，但最好还是根据自己的实际情况和编织经验进行调整。

因此，如果要编织39码的水晶底拖鞋，建议先参考一些编织教程或者询问有经验的编织者，获取一个大致的起针数范围。然后，在实际编织过程中，根据线材的粗细、编织的紧密度以及拖鞋的实际大小进行调整，以达到最佳的编织效果。

需要注意的是，编织拖鞋是一项需要耐心和细心的手工活动，初学者可以先从小码的拖鞋开始练习，逐渐掌握编织技巧后再尝试编织更大码的拖鞋。同时，也要注意选择合适的线材和工具，确保编织出的拖鞋既美观又舒适。