在《名侦探柯南》中，小兰在TV208话中确认了柯南就是新一的身份。此后，他们的故事继续发展，以下是一些重要情节：

1. 柯南继续调查黑暗组织，寻找与组织有关的信息，以便找到解药，恢复原来的身体。

2. 小兰知道柯南的身份后，对他的安全更加担忧，时常为他担心。但她也支持柯南继续调查黑暗组织，因为他相信这样做可以找到新一。

3. 柯南和小兰在日常推理活动中，多次互相救助，他们的感情更加深厚。在危机时刻，他们都会为了对方而拼命保护对方。

4. 他们与其他角色（如少年侦探团、灰原哀等）一起，共同解决了许多疑难案件，展现了他们的智慧和勇气。

5. 在一系列的电影和特别篇中，柯南和小兰的感情得到了进一步的发展。例如，在电影《瞳孔中的暗杀者》中，他们共同面对危机，柯南为小兰挡刀，险些丧命。在这部电影中，小兰也表达了对新一的思念之情。

6. 在《名侦探柯南：红色的修学旅行》中，新一和小兰终于在众人面前坦诚了彼此的感情，并正式确定了恋人关系。

7. 随着故事的推进，新一和小兰的感情越来越深，他们不断互相支持，一起面对困境，直至新一成功恢复原来的身体，两人得以幸福地生活在一起。

总之，在小兰认出柯南之后，他们的故事围绕着寻找黑暗组织、解决疑难案件以及加深彼此的感情展开。经过一系列的冒险和挑战，新一和小兰的感情越发深厚，最终走到了一起。