三条途径。
第一条途径：转为全额事业单位。
第二条途径：维持差额事业单位。这类事业单位无论职能职责上，还是运行方式上，都没有发生什么变化，受改革的影响比较小。
第三条途径：进行整体转企改制。差额拨款事业单位原有一定收费职能，有的也可以参与市场经营，而这类参与市场经营的差额拨款事业单位，很有可能将进行转企改制，变成国有企业。
人员处理:
1、保留原状；
2、随职能调整到新单位；
差额拨款事业单位，按差额比例，财政承担部分，由财政列入预算。单位承担部分，由单位在税前列支，如医院等。
差额拨款单位的人员费用由国家财政拨款，其他费用自筹。这些单位的人员工资构成中固定部分为60%，非固定部分为40%。按照国家有关规定，差额拨款单位要根据经费自主程度，实行工资总额包干或其他符合自身特点的管理办法，促使其逐步减少国家财政拨款，向经费自收自支过渡。
而全额拨款[1]是一种政府财政分配形式，中国主要拨款单位有图书馆、文化馆、各级公办学校、党校、档案局、文化中心、农业局下属的森防管理事业单位、动物疫病控制中心、城建局下城市维护管理的如园林处、公园、绿化站、城肥所、环卫处、疾控中心、防治站等。