在南京公司缴纳的社保在徐州使用，可能会有以下影响：

医疗保险：如果你在南京缴纳的社保中包含医疗保险，那么在徐州使用医保时，可能需要先回南京进行报销，然后再将相关费用转到徐州进行结算。这可能会增加一些时间和经济成本。此外，医保报销比例也可能会因为异地使用而有所降低。

养老保险：养老保险的累计缴纳年限是可以转移的，因此你在南京缴纳的养老保险年限可以转移到徐州，继续累计计算。但是，如果你在徐州退休，领取养老金的标准可能会受到一定影响，因为不同地区的平均工资水平不同，这可能会影响到你的养老金待遇。

失业保险：如果你在南京缴纳的失业保险符合徐州的相关规定，那么在徐州失业时，你可以申请领取失业保险金。但是，具体的领取条件和金额可能会因地区而异，需要具体了解徐州的相关规定。

工伤保险和生育保险：这两项保险通常是针对特定情况的，如果你在南京缴纳的工伤保险和生育保险符合徐州的相关规定，那么在徐州发生工伤或生育时，你可以享受相应的保险待遇。

总的来说，南京公司的社保在徐州使用可能会受到一些限制和影响，具体情况需要根据徐州的相关规定来确定。如果你需要更详细的信息，建议咨询当地的社保机构或人力资源部门。