沭阳新农合到南京就医的报销比例会受到多种因素的影响，包括就医的医院级别、治疗项目、用药种类等。一般来说，新农合的报销比例会根据就医地的医保政策而定，不同级别的城市、不同级别的医院，报销比例都可能不同。

通常情况下，新农合在异地就医的报销比例会相对较低，而且可能还需要先经过当地的医保报销后，再按照新农合的政策进行二次报销。此外，如果治疗涉及到一些特殊的项目或药品，可能还需要满足一定的条件才能获得报销。

因此，要了解沭阳新农合到南京就医的具体报销比例，建议您最好直接咨询当地的医保部门或新农合服务窗口，他们会根据您的具体情况提供详细的解答和指导。同时，也建议您在就医前提前了解南京当地的医保政策，以便更好地规划和治疗。